TOP MRI brain structure group
Summary of activity
Forskningsgruppens aktivitet har huvudsakligt fokus på studiet av morfologiska hjärnförändringar vid schizofreni och bipolär sjukdom. Syftet är att kartlägga etiologiska mekanismer för sjukdomarna. Morfologiska hjärnfynd erhållna från analys av MR-bilder relateras till genetisk variation, kliniska karakteristika och förloppsdata, kognitiv och psykosocial funktion, blodparametrar, förekomst av substansmissbruk och tecken till avvikelser i den tidiga utvecklingen. Genom deltagande i TOP-projektet, Universitet i Oslo, och HUBIN-projektet, Karolinska Institutet, garanteras dels tillgång till välkarakteriserade patient och kontrollmaterial (sammantaget över 800 subjekt och hittills 200 subjekt i uppföljande MRI-undersökningar) dels till kompetenta samarbetsparters.
The group focus is within morphological changes of the brain in schizophrenic and bipolar diseases. The goal is to find the ethological mechanisms behind the diseases. Morphological findings in the brain from analysis of MR-images are related to genetic variation, clinical characteristics and course data, cognitive and psychosocial function, blood parameters, drug abuse, and signs of differences in the early development. Through participation in the TOP project, University of Oslo, and the HUBIN project, Karolinska Institutet, access to patients and controls (now 800 subjects, 200 subjects in follow-up MRI studies) as well as competent partners are guaranteed.
Metoderna är MRI (1,5 T) och datoriserad bildprocessering (FreeSurfer, BRAINS). Vi har tillämpat avancerade statistiska metoder för dataanalys. I samarbete med Uppsala Universitet utvecklar vi en metod för bestämning av kraniofaciella karakterisktika.
The methods used are MRI (1.5 T) and computerized image processing (FreeSurfer, BRAINS). Advanced statistical methods for data analysis has been developed. In cooperation with Uppsala University we have developed methods for deciding craniofacial characteristics.
Gruppen arbeider i nært samarbeid med fMRI gruppen i TOP, og de andre TOP gruppene.
The group works closely with TOP's fMRI group and the other groups of TOP.
Contact information
University of Oslo
Institute of Psychiatry
Section Vinderen
P.O. Box 85 Vinderen
0319 Oslo
Senior personnel
Prof. Ingrid Agartz (director)
Personnel's neuroinformatic skills/background
Glenn Lawyer är computer scientist. Rimol och Rasmussen kompetenta inom MR imaging både funktionell och morfometri samt Rasmussen även MR-DTI och visualisering. Bjerkan är civilingenjör och kompetent med erfarenhet av morfometrisk MR bildanalys (FreeSurfer).
Computer science, MR imaging (both morphometry and fMRI), MR-DTI, visualization and image analysis.
Experimental tools
Tillgång till scanner Rikshopitalet och Ullevål sykehus, främst utnyttjat 1,5 T.
Access to scanner at Rikshospitalet and Ullevål University Hospital (UUH), mostly used is the 1.5 T MR Siemens sonata magnetom system at UUH.
Key publications
- Katarina Varnäs, Glenn Lawyer, Erik G Jönsson, Ragnar Nesvåg, Håkan Hall, Lars Terenius, Göran C Sedvall, Ingrid Agartz. BDNF polymorphisms and frontal cortex morphology in schizophrenia. 2007 Psychiatric Genetics.
- Nesvåg R, Frigessi A, Jönsson E, Agartz I. Effects of alcohol use on brain morphology in chronic schizophrenia. Schizophrenia Research, 2007 Feb;90(1-3):52-61. Epub 2007 Jan 10.
- Hall H, Lawyer G, Sillen A, Jönsson EG, Agartz I, Terenius L, Arnborg S. Bayesian study of potential genetic covariates in schizophrenia. World Journal of Biological Psychiatry, 2007; 8(1):12-22.
- Henriksson KM, Kelly BD, Lane A, Hult R, McNeil TF, Agartz I. A morphometric magnetic resonance method for measuring cranial, facial and brain characteristics for application to schizophrenia: Part 1.Psychiatry Res. 2006 Sep 2; [Epub ahead of print] PMID: 16952447 [PubMed - as supplied by publisher
- Laywer G, Nyman H, Agartz I, Arnborg S, Jönsson EG, Sedvall G, Hall H. Morphological correlates to cognitive dysfunction in schizophrenia as studied with Bayesian regression. BMC Psychiatry, 2006 Aug 10;6(1):31.
- Agartz I, Kulle B, Frigessi A, Sedvall GC, Terenius L, Hall H, Jönsson EG. BDNF gene variants and brain morphology in schizophrenia. Am J of Med Genetics Part B: Neuropsychiatric Genetics, 2006 Jul 5;141(5):513-23.
- Tamagaki, C, Sedvall G, Jönsson E, Okugawa G, Hall H, Pauli S, Agartz I. Altered white to grey matter proportions in the striatum of patients with schizophrenia: a volumetric MRI study. Am J Psychiatry. 2005 Dec;162(12):2315-21.
- Hult R, Agartz I. Multimodal segmentation of MRI of the hippocampus using 3D grey-level morphoplogy combined with artificial neural networks. Medical Image Computing & Computer Assisted Intervention, Lecture Notes in Computer Science, Publisher: Springer-Verlag GmbH, ISSN: 0302-9743, Volume 3540 / 2005, Title: Image Analysis: 14th Scandinavian Conference, SCIA 2005, Joensuu, Finland, June 19-22, 2005. Proceedings Editors: Heikki Kalviainen, Jussi Parkkinen, Arto Kaarna. ISBN: 3-540-26320-9, DOI: 10.1007/b137285, Chapter: p. 272, DOI: 10.1007/11499145_29